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Proteína de cluster híbrido

Uma proteína de ferro com um estranho cluster de ferro, enxofre e oxigénio, e o coração do meu doutoramento.

À esquerda: a proteína inteira, colorida do início (laranja) ao fim (ameixa) da cadeia, com os dois clusters de ferro no meio. À direita: os clusters vistos de perto, com o ferro a castanho, o enxofre a amarelo e o oxigénio a vermelho, e as cadeias laterais que os seguram.

A proteína de cluster híbrido (HCP) das bactérias Desulfovibrio tem um cluster invulgar de átomos de ferro, enxofre e oxigénio, cuja função ainda se discute. Durante o meu doutoramento, entre o ITQB NOVA e o ESRF, resolvemo-la em diferentes estados de oxidação: formas reduzidas de duas espécies a 1,25 e 1,55 Å (1OA0, 1OA1), e a proteína de D. vulgaris purificada e cristalizada inteiramente sem oxigénio, resolvida por MAD à volta da energia de ionização do ferro, a 1,35 Å (1W9M). Os átomos do cluster mudam de posição quando o seu estado redox muda, e a semelhança com a monóxido de carbono desidrogenase deu pistas sobre a sua química.

Os dois artigos foram capa das revistas: o Journal of Biological Inorganic Chemistry em 2003 e a Acta Crystallographica D em Junho de 2008 (artigo de 2003, artigo de 2008).

Entrada no PDB
1W9M no PDBe (também no RCSB PDB)
Publicada
2005-02-04
Resolução
1.35 Å
Artigo
Structural and Functional Relationships in the Hybrid Cluster Protein Family:Structure of the Anaerobically Purified Hybrid Cluster Protein from Desulfovibrio Vulgaris at 1.35 A Resolution (Acta Crystallogr.,Sect.D, 2008)
Mais
Detalhes técnicos, ligações e densidade electrónica

Imagens e vídeo feitos com o UCSF ChimeraX; a vista em 3D é do PDBe Mol*.

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