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NADH desidrogenase do tipo II

Uma enzima respiratória de que as bactérias precisam e nós não, e por isso um possível alvo para antibióticos.

O dímero de NDH-2 (laranja claro e dourado) com FAD (ameixa) e NAD (rosa) ligados em cada subunidade.

A NADH desidrogenase do tipo II (NDH-2) alimenta com electrões a cadeia respiratória de muitas bactérias, incluindo agentes patogénicos, mas os seres humanos e os outros mamíferos não a têm. Isso faz dela um alvo promissor para novos antibióticos. Com os grupos de Greg Cook e Yoshio Nakatani, na Nova Zelândia, e de Judy Hirst, em Cambridge, as estruturas de Caldalkalibacillus thermarum, juntamente com cinética e mutagénese, mostraram que a enzima trata os seus dois substratos em locais separados, o que resolveu anos de resultados contraditórios sobre o seu funcionamento (artigo).

Os cristais eram pequenos, difractavam fracamente e sofriam com os danos da radiação. Para obter um conjunto de dados utilizável, foi preciso recolher com um feixe de microfoco em dezenas de cristais e escolher as melhores cunhas de dados para juntar.

Entrada no PDB
5KMR no PDBe (também no RCSB PDB)
Publicada
2017-01-25
Resolução
3 Å
Artigo
The mechanism of catalysis by type-II NADH:quinone oxidoreductases. (Sci Rep, 2017)
Mais
Detalhes técnicos, ligações e densidade electrónica

Imagens e vídeo feitos com o UCSF ChimeraX; a vista em 3D é do PDBe Mol*.

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