NADH desidrogenase do tipo II
Uma enzima respiratória de que as bactérias precisam e nós não, e por isso um possível alvo para antibióticos.
A NADH desidrogenase do tipo II (NDH-2) alimenta com electrões a cadeia respiratória de muitas bactérias, incluindo agentes patogénicos, mas os seres humanos e os outros mamíferos não a têm. Isso faz dela um alvo promissor para novos antibióticos. Com os grupos de Greg Cook e Yoshio Nakatani, na Nova Zelândia, e de Judy Hirst, em Cambridge, as estruturas de Caldalkalibacillus thermarum, juntamente com cinética e mutagénese, mostraram que a enzima trata os seus dois substratos em locais separados, o que resolveu anos de resultados contraditórios sobre o seu funcionamento (artigo).
Os cristais eram pequenos, difractavam fracamente e sofriam com os danos da radiação. Para obter um conjunto de dados utilizável, foi preciso recolher com um feixe de microfoco em dezenas de cristais e escolher as melhores cunhas de dados para juntar.
- Entrada no PDB
- 5KMR no PDBe (também no RCSB PDB)
- Publicada
- 2017-01-25
- Resolução
- 3 Å
- Artigo
- The mechanism of catalysis by type-II NADH:quinone oxidoreductases. (Sci Rep, 2017)
- Mais
- Detalhes técnicos, ligações e densidade electrónica
Imagens e vídeo feitos com o UCSF ChimeraX; a vista em 3D é do PDBe Mol*.